Gesundheit

Leistungsstarke Sequenzierung Technologien wirft ein Licht auf die DC HIV-Epidemie

Trotz erheblicher Fortschritte gegen HIV/AIDS, der Hauptstadt der nation ist noch immer kämpfen eine HIV-Epidemie mit raten, die sind fünf mal höher als der nationale Durchschnitt. Eine aktuelle Studie Milken Institute School of Public Health Forscher an der George Washington University nutzt die leistungsstarke next-generation-sequencing-Technologie, um zu lernen mehr über, wie das virus verbreitet und die Entwicklung von Resistenzen in den District of Columbia.

Forscher mit GW-s Computational Biology Institute (CBI) erhalten Blutproben von 68 Menschen, die mit HIV Leben im Stadtteil durch Kooperationen mit der DC-Kohorte. Sie sequenzierten das Erbgut entnommen aus dem virus und fand, dass HIV in DC ist sehr vielfältig—das bedeutet, es gibt viele verschiedene Stämme, die in der lokalen Bevölkerung. Die Autoren vermuten, diese Vielfalt ergibt sich aus DC“s position als internationale Drehscheibe mit einer Menge von temporären Bewohner und Besucher.

Die Forscher fanden auch, dass ungefähr die Hälfte der Teilnehmer der Studie hatten mindestens ein Medikament-resistenten HIV-Stamm. Diese Informationen könnten verwendet werden, um dazu beitragen, zielgerichtete, wirksamere Medikamente, um Menschen mit resistenten HIV.

„Unsere Befunde einer genetisch vielfältigen und komplexen HIV-Epidemie in DC sind wissenschaftlich wichtig“, sagte Keylie M. Gibson, der vor kurzem verteidigte Ihre dissertation an der GW und führen Autor der Studie. „Zur gleichen Zeit, diese Studie erlaubt uns zu geben, zurück in den Stadtteil und die Gemeinschaft durch public health outreach und Zusammenarbeit mit Organisationen wie der DC-Kohorte.“

Verschiedene Subtypen von HIV am meisten verbreitet in verschiedenen teilen der Welt. Subtyp B ist der häufigste in Nordamerika und Europa. Das wissen über die Subtypen sind Häufig in einer bestimmten geographischen Lage hilft ärzten identifizieren, die die meisten wirksame Behandlung für den einzelnen Patienten.

„Im Idealfall wollen wir ärzte wissen, dass es könnte anders sein, werden Arzneimittel-resistente Mutationen in Umlauf, und Sie konnten sich über etwas, was Sie nicht sind, gewohnt zu sehen, oder nicht sehr weit verbreitet,“ Dr. Gibson sagte. „Dieses wissen könnte dazu führen, Sie zu verschreiben verschiedene Medikamente oder zumindest offen sein für die Idee, dass ein patient möglicherweise müssen ein anderes Medikament Kombination, basierend auf Drogen-resistente mutation profile in den verschiedenen Subtypen.“

Die Studie wurde durchgeführt von einem team der Bioinformatik Wissenschaftler und Epidemiologen enthalten, dass Dr. Gibson und Marcos Pérez-Losada, ein assistant professor in der CBI. Mithilfe von next generation sequencing-Technologie zusammen mit epidemiologischen Daten, das team war in der Lage, anzeigen, wie die verschiedenen HIV-Stämme übertragen worden im Bezirk. Lernen Sie mehr über die Faktoren, die in solche Netzwerke können verwendet werden, um zu verhindern, dass neue Fälle auftreten und zu eine effektive Behandlung für diejenigen, die bereits infiziert sind, so die Autoren.

„Unsere Ergebnisse geben uns wichtige Hinweise über die Verbreitung, Diversität und evolution von HIV in Washington, DC,“ sagte Dr. Perez-Losada. „Solches wissen kann verwendet werden, zu entwickeln, bessere Methoden für die HIV-Prävention und Behandlung.“